بنیاد امور بیماری‌های خاص به عنوان یک نهاد خیریه معتبر با مجوز رسمی، تمام کمک‌های دریافتی را تحت نظارت هیأت امنا و با رعایت کامل قوانین شفافیت مالی هزینه می‌کند.

همچنین بنیاد عضو شورای اقتصادی-اجتماعی سازمان ملل (ECOSOC) و فدراسیون‌های بین‌المللی تالاسمی و کلیه است و گزارش‌های مالی آن به‌صورت دوره‌ای ارائه می‌شود.

بنیاد امور بیماری‌های خاص از بدو تأسیس، بیماران دیالیز، تالاسمی و هموفیلی را تحت پوشش داشته و به مرور زمان، به دلیل شیوع و هزینه‌های بالای درمان، بیماران سرطان، ام‌اس، پیوند کلیه، دیابت، اوتیسم و ای‌بی (EB) را نیز به جمع بیماران تحت پوشش خود افزوده است.

بنیاد با بیش از ۹۸۰ مرکز درمانی همکاری داشته و خدمات خود را در سراسر کشور ارائه می‌دهد.